Work information

Title Scripts Bioestadística: RNAseq
Grupos de scripts desarrollados por HelixBios para el análisis de datos provenientes de experimentos de RNA-seq:

+ rna_bulk: scripts desarrollados para los análisis de expresión diferencial de proyectos de secuenciación de tipo bulk-RNA-seq tanto a nivel de gen como a nivel transcrito.



+ rna_circular: scripts desarrollados para las diferentes etapas del análisis de expresión diferencial de proyectos secuenciación de especímenes de RNA circulares.



+ rna_clustering: scripts desarrollados para clasificar mediante técnicas jerárquicas no supervisadas diversos tipos celulares en función del perfil de expresión génica y transcriptómica a partir de datos de conteo y FPKMs.


+ rna_denovo: scripts desarrollados para el análisis de expresión diferencial de transcritos o especímenes de RNA cuyo pseudo-alineamiento y cuantificación se ha realizado mediante el programa Kallisto.


+ rna_micro: scripts desarrollados para los análisis de expresión diferencial de proyectos de secuenciación de tipo RNA-seq para microRNAs (maduros, pre-maduros, precursores, etc.).

+ rna_compare: scripts desarrollados para la determinación de los códigos de clasificación de transcritos mediante gffcompare a partir de datos de RNA-seq.


Grupos de scripts auxiliares desarrollados por HelixBioS para dar soporte al análisis de datos provenientes de experimentos de RNA-seq:

+ bases: scritps desarrollados para la extracción, importación, limpieza y manejo de datos provenientes de bases de datos relacionadas con los diferentes pipelines de análisis de datos de RNA-seq.

+ biblio: scripts y archivos que recogen la bilbiografía consultada y utilizada en el desarrollo y puesta a punto de los pipelines de análisis de RNA-seq antes mencionados. Recoge archivos .bib con el formato de bibliográfico requerido por R y archivos .csl con los diferentes estilos bibliográficos aceptados por las publicaciones científicas.

+ css: scripts y archivos que permiten crear documentos .html

+ funciones: scripts y funciones creados para la ejecución y ayuda en los diferentes pipelines de análisis de datos de RNA-seq.
Work type Software and Database designs
Tags helix bioinformatics solutions, carlos garrido- allepuz herrera, análisis datos, raquel álvarez tello, helix bios, desarrolladores, virginia sebastián ibáñez, jose maria lezcano valvderde, rna-seq, experimentos, software, scripts, s.l.

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Registry info in Safe Creative

Identifier 2212232952882
Entry date Dec 23, 2022, 5:39 PM UTC
License All rights reserved
Copyright info provided by 4U ABOGADOS TORRALBA Y FEDRA S.L.P.,

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Copyright registered declarations

All exploitation rights . Holder HELIX BIOINFORMATICS SOLUTIONS, S.L.. Date May 11, 2026.
Author. Holder JOSE MARIA LEZCANO VALVDERDE. Date May 11, 2026.
Author. Holder Carlos Garrido- Allepuz Herrera. Date May 11, 2026.
Author. Holder Virginia Sebastián Ibáñez. Date May 11, 2026.
Author. Holder Raquel Álvarez Tello. Date May 11, 2026.


Information available at https://www.safecreative.org/work/2212232952882-scripts-bioestadistica-rnaseq