La pandemia de Covid-19, decretada el día 11 de marzo de 2020 por la OMS, ha conseguido llevar al límite nuestros recursos sanitarios, en especial, los hospitalarios. La neumonía severa causada por HCoV patógenos a menudo se asocia con una rápida replicación del virus, infiltración masiva de células inflamatorias y elevadas respuestas de citoquinas/quimioquinas proinflamatorias (conocida como “tormenta de citoquinas”) que resultan en lesión pulmonar aguda y síndrome SDRA. Los trastornos de coagulación e incluso algunas de las alteraciones pulmonares y neurológicas podrían estar en relación con un síndrome antifosfolípido. Estas características clínicas sugieren la probabilidad de implicación de una afección altamente proinflamatoria en la progresión y gravedad de la enfermedad.
El transcriptoma es una poderosa aproximación del estado fisiológico de una célula, sana o enferma siendo, por lo tanto, una herramienta clave para comprender los cambios moleculares que acompañan a las infecciones de las células eucariotas. La creciente sensibilidad de la secuenciación de RNA de alto rendimiento ahora permite estudios de "doble secuencia de RNA", capturando simultáneamente todas las clases de transcripciones codificantes y no codificantes tanto en el patógeno como en el huésped. No tenemos una clara visión de cómo es la interacción patógeno-huésped con la infección por SARS-CoV-2, sobre todo en los pacientes más graves. La caracterización de la respuesta transcripcional del huésped a la infección por SARS-CoV-2 mediante técnicas de RNA-seq permitiría obtener como resultado, la identificación de genes y la cuantificación de sus niveles de expresión de aquellos genes que tengan un papel preponderante en las respuestas celulares inmunes y metabólicas a la infección por SARS-CoV-2.
El objetivo de este proyecto es establecer el perfil transcriptómico de pacientes leves y graves por Covid19, que permitan una mejor comprensión de las bases moleculares de la enfermedad permitiendo un amplio rango de aplicaciones, especialmente en:
- Identificación de marcadores de expresión los cuales, permita una predicción temprana del agravamiento de la enfermedad pudiendo anticipar pautas terapéuticas.
- Seguimiento de la evolución del paciente grave, a través de los marcadores de expresión, con el fin de determinar el grado de respuesta al tratamiento.
- Correlación el perfil transcriptómico a la respuesta a nuevos tratamientos, incluyendo el reposicionamiento de fármacos.
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